AI模型助力構建我國玉米骨干自交系突變體庫
/yumi/ 2025年12月16日 期貨日報中國農業科學院作物科學研究所
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近日,中國農業科學院作物科學研究所作物基因組選擇技術與應用創新團隊聯合國內外科研團隊完成了我國玉米骨干自交系“昌7-2”的高質量基因組圖譜,構建了超過250萬個化學誘變位點的突變庫,并完成了系統性功能注釋。相關研究成果發表在《基因組生物學(Genome biology)》上。
“昌7-2”是我國玉米雜交育種中重要的父本材料,具有配合力強、抗旱耐瘠薄、廣適等特性,是解析玉米雜種優勢和農藝性狀遺傳基礎的理想材料。構建“昌7-2”的突變體庫資源,有利于深入挖掘和利用其優良基因。
科研團隊成功組裝了“昌7-2”的高質量基因組,并對創制的1716個化學誘變株系進行了全基因組測序,構建了包含250萬個突變位點的大規模突變體庫。隨后,科研團隊創新性地引入蛋白質語言模型與DNA語言模型兩種大型AI模型,對該突變體庫中全部突變進行功能預測,成功篩選出4個調控玉米重要農藝性狀的關鍵基因,并驗證了該策略的高效性與準確性。此外,科研人員發現部分同義突變可能影響基因的轉錄水平。該研究為理解突變功能提供了新視角,為玉米功能基因挖掘與育種提供了遺傳資源和數據平臺。
該研究得到國家重點研發計劃、國家自然科學基金等項目支持。
原文鏈接:https://doi.org/10.1186/s13059-025-03890-2
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文章來源:期貨日報中國農業科學院作物科學研究所
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